MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013967	GAC	2	6	1	6	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013967	CG	3	6	31	36	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013967	CCCG	2	8	57	64	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_013967	CGG	3	9	82	90	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013967	CAT	2	6	142	147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013967	CTT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013967	CGC	3	9	212	220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013967	GGC	2	6	4544	4549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013967	ACT	2	6	4559	4564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013967	GAC	2	6	4565	4570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013967	GCG	2	6	4628	4633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013967	CG	3	6	5814	5819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013967	CGG	2	6	5825	5830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013967	CGG	2	6	6760	6765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013967	TC	3	6	6769	6774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013967	CGT	2	6	6776	6781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013967	ACC	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013967	GTAT	2	8	6811	6818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013967	GCCG	2	8	6836	6843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013967	CCGC	2	8	7316	7323	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_013967	GGA	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013967	C	6	6	7402	7407	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_013967	GCGAC	2	10	7446	7455	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013967	GGA	2	6	7461	7466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013967	CGG	2	6	10948	10953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013967	CGTC	3	12	11575	11586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013967	CGA	2	6	11593	11598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013967	CGG	2	6	11606	11611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013967	TGG	2	6	11723	11728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013967	C	6	6	11770	11775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_013967	GTTT	2	8	11821	11828	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013967	ACC	2	6	11860	11865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013967	TCGGT	2	10	14912	14921	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013967	CGG	2	6	14963	14968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013967	CGA	2	6	15235	15240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013967	TC	3	6	15252	15257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013967	CTT	2	6	15259	15264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013967	CCG	2	6	15286	15291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013967	CGAC	2	8	15336	15343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013967	GCG	2	6	15363	15368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013967	CGA	2	6	15398	15403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013967	CTG	2	6	15436	15441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013967	CGT	2	6	15444	15449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013967	TCG	2	6	15452	15457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013967	GCG	2	6	16982	16987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013967	CGC	2	6	17015	17020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_013967	CGT	3	9	17493	17501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013967	CGG	2	6	17504	17509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013967	CG	3	6	17519	17524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013967	G	7	7	17527	17533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013967	GTC	3	9	17543	17551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013967	CGGTC	2	10	17569	17578	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013967	GC	3	6	17598	17603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013967	CGG	2	6	18298	18303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013967	ACCG	2	8	18308	18315	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013967	CGG	2	6	19442	19447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013967	GTT	2	6	22386	22391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013967	CTCG	2	8	23402	23409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013967	CTC	2	6	24224	24229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013967	TGT	2	6	24261	24266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013967	TCG	2	6	24327	24332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013967	TC	3	6	24333	24338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013967	TGT	2	6	24419	24424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013967	GCC	2	6	25299	25304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013967	ACCG	3	12	25326	25337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013967	ATA	2	6	26813	26818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013967	AT	3	6	26821	26826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013967	GTC	3	9	26887	26895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013967	GTC	2	6	26905	26910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013967	CGC	3	9	26929	26937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013967	TCAC	2	8	27583	27590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013967	ACCC	2	8	27609	27616	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_013967	ACG	2	6	27648	27653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013967	GC	3	6	27668	27673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013967	TTCG	2	8	27748	27755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013967	CG	3	6	27776	27781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013967	TGAG	2	8	27789	27796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013967	CCG	2	6	27822	27827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_013967	TCC	2	6	28135	28140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013967	CGC	2	6	28168	28173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013967	ACG	2	6	28180	28185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013967	CG	3	6	30754	30759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013967	GT	3	6	30763	30768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013967	TTA	2	6	30804	30809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013967	CGG	2	6	30850	30855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013967	CAC	2	6	30879	30884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_013967	AAC	2	6	31108	31113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013967	ACC	2	6	32216	32221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013967	ACC	2	6	32225	32230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_013967	CAC	2	6	32239	32244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013967	GCTC	2	8	32726	32733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_013967	ATT	2	6	33268	33273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013967	GGT	2	6	33413	33418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013967	GACGCC	2	12	33421	33432	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013967	TC	3	6	33435	33440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013967	GGA	2	6	33452	33457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013967	CGGG	2	8	33493	33500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013967	GAC	2	6	33584	33589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013967	ACG	2	6	33623	33628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013967	G	6	6	34762	34767	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013967	CGA	3	9	34817	34825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013967	GAC	2	6	34827	34832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013967	GAG	2	6	34833	34838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013967	TGG	2	6	34879	34884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013967	CCA	2	6	34942	34947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_013967	CGA	2	6	35186	35191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013967	TC	3	6	35204	35209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013967	CGG	2	6	35744	35749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013967	CGG	2	6	37187	37192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013967	GCC	2	6	39451	39456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013967	C	6	6	39477	39482	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_013967	CCG	2	6	39487	39492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_013967	TGCGG	2	10	39523	39532	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013967	GCC	2	6	39537	39542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013967	GCG	2	6	40070	40075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013967	GT	3	6	40999	41004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013967	TCG	2	6	41022	41027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013967	GTC	3	9	41041	41049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013967	GACG	2	8	46503	46510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013967	AAG	2	6	46552	46557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013967	CGA	2	6	46588	46593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013967	ACG	2	6	46608	46613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013967	GTC	2	6	46660	46665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013967	GTCG	2	8	46689	46696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013967	GTC	3	9	46699	46707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013967	GTC	2	6	46726	46731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013967	GTC	2	6	46744	46749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013967	GCG	2	6	46750	46755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013967	GTC	2	6	46768	46773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013967	AC	3	6	49511	49516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013967	GAT	3	9	49613	49621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013967	CGT	2	6	49639	49644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013967	TGC	2	6	49691	49696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013967	ACG	2	6	49721	49726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013967	CTC	2	6	49902	49907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013967	TCGG	2	8	49934	49941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013967	CGC	2	6	49959	49964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_013967	CGA	2	6	51680	51685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013967	GCC	2	6	51707	51712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_013967	C	6	6	54974	54979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_013967	CCG	3	9	55023	55031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_013967	GGA	2	6	55044	55049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013967	GAC	2	6	55681	55686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013967	GGT	2	6	55716	55721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013967	TTG	2	6	61115	61120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013967	CTG	2	6	61189	61194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_013967	TTTG	2	8	63181	63188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_013967	CACTC	5	25	102928	102952	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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273	NC_013967	TCG	2	6	105140	105145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_013967	CGG	2	6	109483	109488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_013967	GAC	2	6	109508	109513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_013967	ACCG	2	8	109514	109521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
282	NC_013967	ACC	2	6	110188	110193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_013967	GTC	2	6	110762	110767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_013967	GGTC	2	8	110768	110775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
285	NC_013967	GCC	2	6	110777	110782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_013967	GGA	2	6	110879	110884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013967	C	6	6	112018	112023	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
288	NC_013967	CGAC	2	8	112076	112083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
289	NC_013967	CCT	2	6	112752	112757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_013967	CGT	2	6	114150	114155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_013967	TTTC	2	8	114159	114166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
292	NC_013967	CG	3	6	114798	114803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
293	NC_013967	TCG	2	6	114814	114819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_013967	GCCGA	2	10	115823	115832	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
295	NC_013967	GC	3	6	115873	115878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
296	NC_013967	CG	4	8	117295	117302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
297	NC_013967	CGC	2	6	117310	117315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
298	NC_013967	TGCC	2	8	117324	117331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
299	NC_013967	CG	3	6	117332	117337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
300	NC_013967	CCTCG	2	10	117342	117351	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
301	NC_013967	CCG	2	6	117365	117370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
302	NC_013967	CCGA	2	8	118578	118585	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
303	NC_013967	ACCG	2	8	118606	118613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
304	NC_013967	AAG	2	6	119645	119650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_013967	ACC	2	6	120761	120766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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311	NC_013967	CTCG	2	8	121310	121317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
312	NC_013967	CG	3	6	121316	121321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
313	NC_013967	CG	3	6	121416	121421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
314	NC_013967	TTG	2	6	121443	121448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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317	NC_013967	CTCG	2	8	121491	121498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
318	NC_013967	CG	3	6	121497	121502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
319	NC_013967	CCG	2	6	121564	121569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
320	NC_013967	CGG	2	6	121581	121586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
321	NC_013967	TCCTG	2	10	121597	121606	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
322	NC_013967	GTTCT	2	10	121612	121621	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
323	NC_013967	CGA	2	6	121622	121627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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325	NC_013967	GCG	2	6	121691	121696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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329	NC_013967	GAC	2	6	122194	122199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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333	NC_013967	GAT	2	6	122850	122855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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342	NC_013967	A	6	6	124799	124804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_013967	CGA	2	6	144373	144378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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415	NC_013967	CGT	2	6	155932	155937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_013967	CGG	2	6	157100	157105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_013967	GGC	2	6	157107	157112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_013967	CCG	2	6	157144	157149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
419	NC_013967	CGA	2	6	157150	157155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_013967	CA	3	6	157164	157169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
421	NC_013967	CGC	2	6	157801	157806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_013967	CGA	2	6	157829	157834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_013967	GCG	2	6	157840	157845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_013967	GGT	2	6	157891	157896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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